한일 위안부 협상 타결 소식에 교계는 진보, 보수로 나뉘어 엇갈린 반응을 보이고 있다. 하지만 금번 위안부 협상에 위안부 피해자들의 목소리가 적극 반영되지 않았다는 점에서는 부정적 목소리가 더 컸다.
위안부 타결 소식을 전후해 속속 발표된 성명의 면면을 살펴보면 우선 기장총회(총회장 최부옥 목사, 이하 기장), 기독교윤리실천운동(이사장 홍정길 목사, 이하 기윤실), 세계한인기독교총연합회(대표회장 김요셉 목사, 이하 세기총) 등은 대체로 부정적 반응을 보였다.
기장은 '위안부 문제 법정책임 배제된 합의는 국민에 대한 기만'이라는 제목의 논평에서 "지난 28일, 일본군 위안부문제 해결을 위한 한일 외교장관 회담은 외교적 담합일 뿐이며 졸속적이고 굴욕적인 회담"이라 평하고, "일본군이 조직적으로 개입한 국가적 범죄행위에 대한 법적 책임이 인정되지 않았을 뿐 아니라 피해당사자의 입장의 전혀 반영되지 않았기 때문"이라 지적했다.
그러면서 정부를 향해 "박근혜 정부는 국민의 편에서 국민을 위한 외교를 수행해야 한다"면서 "'일본대사관의 안녕 및 위엄유지'를 위해 '소녀상' 이전을 고려하겠다고 약속하는 것은 국민을 배신하는 것"이라 질타했다. 아베 총리를 향해서도 "우리 민족에게 범한 침략과 강점의 과오를 인정하고 진정한 사과로 위안부 할머니의 용서를 구해야 한다"면서 ▲일본은 위안부 문제의 가해국으로 자인하고 법적책임에 성실히 임하라 ▲박근혜 정부는 일본에 대한 굴욕적인 외교를 그치고 위안부 할머니의 명예회복을 위한 외교를 수행하라고 촉구했다.
기윤실도 이번 위안부 협상에 대해 "이 문제의 당사자인 피해자들의 입장이 반영되지 않았고, 일본 정부의 법적인 배상책임 이행에 대한 구체적인 언급이 없다"고 지적하고, "향후 위안부 문제를 재론하지 않기로 했다는 등 협상이 아닌 한일 간 담합"이라 비판했다. 그러면서 정부에 대해 위안부 피해자들의 목소리를 반영해 "재협상"을 하라고 촉구하기도 했다.
위안부 협상에 부정적인 반응과 달리 긍정적인 입장 표명도 있었다. 주로 교계 보수파 관련 단체들이다. 한국기독교총연합회(대표회장 이영훈)는 "양국이 합의를 한 것에 대해 높이 평가하며, 합의를 이끌어 내기위해 결단을 내리고 외교적 역량을 총동원한 우리 정부의 노력에 격려 한다"면서 "양국이 상생과 도약의 미래 50년을 만들어 나가는 기초가 되기를 기대한다"고 밝혔다.
한국교회언론회도 긍정적 입장을 밝혔다. 언론회는 이번 위안부 협상 타결에 "박근혜 대통령의 '집요하리 만큼 집중력 있는 외교적 추궁에 의한 것'이라는 평가를 받고 있다"며 박 대통령을 치켜세웠고, "지난 1992년부터 시작된 위안부 할머니들의 1,200회가 넘는 집회와, 이를 지지하는 우리 국민들과, 이를 받아들여 일본을 꾸짖는 국제 사회의 역할들이 주효했다"고도 했다.
이 밖에 한국장로교총연합회(대표회장 백남선 목사)는 "위안부 협상"과 "외교 문제"를 저울질하며 금번 위안부 합의를 외교적 관점에서 "이번 한일 외교장관회담을 계기로 양국의 관계발전과 세계 평화에 기여하는 계기가 실질적으로 이루어지기를 기대한다"고 전했다. 위안부 개개인의 피해자 명예 회복 못지 않게 중요한 것이 한일 외교관계의 정상화라는 논리다.