한국교회총연합(UCCK, 대표회장 전계헌, 최기학, 전명구, 이영훈)은 9월 18일(화)부터 20일(목)까지 열린 제3차 남북정상회담과 관련하여 논평을 발표하고 "남북정상회담에서 이룬 합의를 환영한다"고 밝혔다. 이어 "정상 합의로 남북간 군사적 긴장해소와 평화공존, 비핵화와 교류협력에 관한 진전된 성과를 이루었으니, 남북은 이번 합의사항을 절차에 따라 신속하게 조치를 취하여 민족의 공동번영의 미래를 열어가기를 바란다"고 덧붙였다.
UCCK는 대한민국 정부에 대해 "남북간 합의 진전에 따라서 남북교류를 확대하고 민족통합의 길을 열어주기를" 요청하면서 "보수와 진보로 나뉘는 남남갈등을 해소하고 사회통합을 이루는 정책으로 전환하기를 기대한다"고 밝혔다. 그리고 "야권과 종교 및 시민사회가 민족문제 해결에 동참하기를" 바라는 기대도 표명했다.